История Уфимского гарнизонного военного суда начинается с Директивы Генерального штаба Вооруженных Сил СССР от 28 декабря 1972 года № 314/9/01728, согласно которой военному трибуналу Домбаровского гарнизона предписывалось передислоцироваться в город Уфу Башкирской АССР и он переименовывался в военный трибунал Уфимского гарнизона, начав свою работу 9 марта 1973 года. Именно с этой даты идёт исчисление истории Уфимского гарнизонного военного суда, который в 2023 году перешагнул пятидесятилетний рубеж своего существования.

 Изначально, военному трибуналу для осуществления своей деятельности были выделены помещения в здании Военного комиссариата Республики Башкортостан на улице К. Маркса, дом 14, в городе Уфе, а с 15 мая 1995 года военный суд Уфимского гарнизона разместился в здании на улице К.Маркса, дом 55, где располагался в течение более 27 лет.

Данное здание военного суда, расположенное на ул. К. Маркса (бывшая улица Александровская), было возведено по распоряжению Императора Александра I посетившего город Уфу в сентябре 1824 года и отдавшего распоряжение о строительстве Казарм внутренней стражи. Всего был построен комплекс казарм из 5 зданий и других помещений и по окончании строительства в 1838 году в них разместились военные части Уфимского гарнизона, откуда русские солдаты уходили на различные войны вплоть до Великой Отечественной войны.

В связи с упразднением структур судебной власти СССР, постановлением Президиума Верховного Совета Российской Федерации от 28 декабря 1991 года «О военно-судебных органах, дислоцированных на территории РСФСР» и от 13 января 1992 года «О военных трибуналах» Военная коллегия и военные трибуналы были включены в судебную систему Российской Федерации, а Управление военных трибуналов – в состав Министерства юстиции Российской Федерации.

21 апреля 1992 года Съездом народных депутатов России было внесено дополнение в действующую тогда Конституцию Российской Федерации, в соответствии с которым военные трибуналы также были включены в судебную систему и им возвращено прежнее название – военные суды.

29 июня 1999 года вступил в силу Федеральный конституционный закон от 23 июня 1999 года № 1-ФКЗ «О военных судах Российской Федерации», который позволил сохранить формировавшуюся в течение десятилетий систему военных судов, их кадровый состав, материально-техническую базу, накопленный теоретический и практический потенциал и создал правовую основу для их дальнейшей деятельности.

Принятие данного закона было обусловлено объективными требованиями времени, поскольку до этого деятельность военных судов регулировалась разрозненными правовыми актами, что приводило порой к возникновению противоречий и затрудняло их применение.

В законе была определена подведомственность и подсудность уголовных, гражданских дел и дел об административных правонарушениях военным судам, как по их категориям, так и по судебным инстанциям начиная от гарнизонного военного суда и до Военной коллегии Верховного Суда Российской Федерации, а так же урегулированы все другие вопросы судебной работы.

В целях приведения структуры военных судов в соответствие с законом «О военных судах Российской Федерации» в том же году, в соответствии с Приказом Председателя Верховного Суда Российской Федерации от 09 декабря 1999 года № 435-кд военный суд Уфимского гарнизона был переименован в Уфимский гарнизонный военный суд.

Федеральным конституционным законом от 29 июня 2009 года № 3-ФКЗ были внесены изменения в ФКЗ «О военных судах Российской Федерации», которыми упразднены институты прикомандирования военнослужащих к военным судам и прохождения военной службы военнослужащими на должностях в аппаратах судов, т.е., фактически, с указанного времени судьи и сотрудники аппарата военных судов перестали быть военнослужащими.

Важным этапом совершенствования законодательства о судебной системе стало принятие в 2018 года сразу нескольких федеральных законов, которые существенным образом затронули и военно-судебную систему.

Так, в результате реформы были созданы Кассационный военный суд с местом постоянного пребывания в городе Новосибирске, Апелляционный военный суд с местом постоянного пребывания в городском округе Власиха Московской области, Центральный окружной военный суд с местом пребывания в городе Екатеринбурге Свердловской области и его постоянное судебное присутствие в городе Самаре. Именно Центральному окружному военному суду, помимо иных 12 гарнизонных военных судов, чья юрисдикция распространяется на 18 субъектов Российской Федерации, поднадзорен Уфимский гарнизонный военный суд.

Необходимо отметить, что согласно действующему уголовно-процессуальному законодательству Центральный окружной военный суд является судом, в числе иных окружных (флотских) судов в Российской Федерации, к подсудности которого отнесены наиболее значимые уголовные дела о преступлениях террористической и экстремистской направленности. Немалую роль в рассмотрении таких дел играет и Уфимский гарнизонный военный суд, осуществляющий «сопровождение» этих дел путём рассмотрения досудебных ходатайств органов предварительного следствия, организации и проведения видеоконференц-связи с отдельными участниками судопроизводства, ознакомления лиц, содержащихся под стражей с материалами дела и выполнения иных судебных поручений, на стадиях от рассмотрения этих дел в суде первой инстанции – окружном военном суде и заканчивая высшей судебной инстанцией – Верховным Судом РФ.

Согласно последним изменениям, в соответствии со статьёй 1 Федерального закона от 29.12.2020 № 466-ФЗ «О территориальной юрисдикции гарнизонных военных судов», в настоящее время юрисдикция Уфимского гарнизонного военного суда распространяется на территории Республики Башкортостан и Удмуртской Республики, т.е. на территории сразу двух вышеназванных субъектов Российской Федерации. При этом в г. Ижевске находится судебный состав Уфимского гарнизонного военного суда численностью 4 человека: судья, помощник судьи, секретарь судебного заседания и консультант суда. Вместе с тем, в настоящее время в оговоренном судебном составе осуществляют свою деятельность только два сотрудника: помощник судьи и консультант суда.

27 октября 2022 года председателем суда было проведено последнее судебное заседание по уголовному делу в здании, расположенном на ул. К. Маркса в г. Уфе, и с 31 октября 2022 года Уфимский гарнизонный военный суд передислоцирован в новое здание, отвечающее всем современным требованиям для качественного отправления правосудия - на ул. Менделеева в г. Уфе.